Glavni direktor Zračne luke Zagreb d.o.o. donio je Politiku upravljanja okolišem. Upravljanje okolišem utemeljeno je na principima održivog razvoja i zahtjevima međunarodne norme ISO 14001:1996 i dio je integriranog sustava kvalitete Zračne luke Zagreb.

Ono obuhvaća sve organizacijske dijelove, imenovane poslovne procese i aspekte okoliša. Politika upravljanja okolišem obvezuje sve zaposlene i ugrađena je u sve dokumente integriranog sustava kvalitete Zračne luke Zagreb. Djelotvornost sustava periodično se ispituje i ocjenjuje od strane Uprave.

U sistemu upravljanja okolišem vodi se računa o ovih pet aspekata: voda, otpad, zrak, buka i energija. Voda je naročito bitan aspekt jer se Zračna luka Zagreb nalazi u neposrednoj blizini vodozaštitnog područja. Velike količine oborinskih voda kontrolirano se odvode preko dva separatora i bezbroj lokalnih taložnika i mastolovaca.

Velika se pažnja posvećuje i utrošku energije. Potrošnjom električne energije upravlja se uz pomoć računala za selektivno i automatsko uključivanje i isključivanje potrošača. Loživo ulje i mazut zamjenjeni su čišćim energentom - plinom.